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新工具有助于多倍体植物的遗传定位

放大字体  缩小字体 发布日期:2019-11-09 14:19  浏览次数:0
摘 要:一个创新的多倍体物种遗传图谱系统有望促进科学家和植物育种家的工作,他们利用基因组学来开发更高产、更能抵抗疾病或干旱的品种
 一个创新的多倍体物种遗传图谱系统有望促进科学家和植物育种家的工作,他们利用基因组学来开发更高产、更能抵抗疾病或干旱的品种。多倍体是具有两套以上染色体的生物体。许多具有经济价值的植物如马铃薯、小麦、棉花和甘蔗都是多倍体。
 
这项研究是在圣保罗州(巴西)皮拉西卡巴的圣保罗大学路易斯德奎罗斯农业学院(ESALQ-USP)进行的,得到了圣保罗研究基金会FAPESP的支持。研究结果发表在《G3:基因,基因组,遗传学》杂志上。
 
这个开源软件包名为mapply,可以从互联网上免费下载。
 
迄今为止,只有二倍体物种(2n)或简单多倍体(4n)的遗传定位系统可用(n是指每个细胞中唯一染色体的数目)。对于复杂的多倍体(Xn,多拷贝),染色体有更多可能的组合,而且作图过程很难进行。
 
许多作物经过基因改良,是多倍体。例如,甘薯(Ipomoea batatas)是六倍体(6n,每个染色体有六个拷贝)。在巴西和其他地方,糖类和乙醇生产商种植的甘蔗品种介于6n和14n之间,从基因研究的角度来看,这是一个艰巨的挑战。
 
寻找一种绘制这种复杂植物遗传图谱的方法,是目前美国罗利北卡罗来纳州立大学博士后研究员马塞洛·莫利纳里(Marcelo molliari)最初的研究重点。他在ESALQ-USP遗传学系教授安东尼奥·奥古斯托·佛朗哥·加西亚(Antonio Augusto Franco Garcia)的指导下进行博士后研究,并获得FAPESP的奖学金,从而发展了他的大部分系统。
 
“利用统计遗传学的知识和工具,这项研究产生了一种新的方法,有力地解决了这一挑战,”莫利纳里说,他之前曾获得FAPESP奖学金,在印第安纳州西拉斐特的普渡大学(Purdue University)进行研究实习。
 
这项研究还获得了FAPESP生物能源研究计划(BIOEN)的资助,该计划的项目是“甘蔗的基因组辅助育种:使用分子标记了解数量性状的遗传结构并实施标记辅助选择”,主要研究者是研究员Anete Pereira de Souza在圣保罗州坎皮纳斯大学分子生物学和基因工程中心(CBMEG-UNICAMP)。
 
 
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